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随着时间的推移，帝国很长时间都没有来犯入侵蓝星，人们在地表世界生活得越来越好，人们开心地生活着。
突然，联军收到一些消息，似乎地表世界的一些区域爆发了未知病毒，导致许多人员感染。
这些被感染者突然变得失去理智，疯了一样地袭击人们，并且这些感染者变得越来越多，成群结队地开始攻击附近的人们。
于是，地联紧急召开了会议，讨论这个情况。
一些代表说，这些感染的人类和我们之前消灭的变异者类似，都是高度危险的，具有很强的传染性。
于是，地联得出结论：这应该是帝国释放的病毒。
并且，地联派出了部队对受感染区域进行清理，将一些感染者消灭。
随着越来越多的地联士兵来到到被感染的区域消灭变异体，清除行动并没有起到多大的效果，反而越来越多的人类被感染成为变异体。
人们四处躲避不敢出门，一些人在表达着自己的恐惧和害怕。许多人类表示，还是之前的地下城市安全一些。
随后，地联召开了紧急会议，决定将人类转移撤到更安全地下城市中生活，并开始清理这些被变异体。
于是，地表世界开始了声势浩大的迁移。
大量的地联部队组织人员撤离地表，人们通过飞行器以及一些运输网络来到地下城市。
不时出现感染者的袭击，都被地联的人解决了。
随着人类撤离，地表世界彻底被感染者占领。
感染者在地表四处游荡，并且许多动物也被病毒感染了。
感染者有相互吞噬的情况发生。地表完全不适合人类的生存。
这时，来到地下世界的人类在一起抱团取暖，共同生活。
地下城市十分安全，还可以维持良好的生活环境，有充足的食物和使用的资源。
地联评估这次病毒爆发造成了地表三分之一的人类被感染。
地联通过对一些重要资源设施的清理，在地表一些位置建立了安全区域，维持一些必要的生产资源的运作。
地联发现，许多的变异体会成群结队地不远数公里来到一些地联的设施附近围攻地联建立的安全区，就好像这些感染者有千里眼一样。
地联通过设施周围建立的防御武器，持续地清除这些感染者。
陈平提议：“或许我们可以在地表建立和清理出一些区域，让人们生活。”
地联接受了这个提议，于是派出部队在一些位于地表的重要位置清理变异体准备建设大型城市。
地表世界被这些变异者占领，只有少数的人类必要设施被地联保护起来运作。
一些地联的人开始在一些地表适合居住的位置清理变异者，并且建造了隔离设施围墙，将区域隔开，并且在其中建立了新的地表城市。
在经过一段时间的建设后，已经可以生活居住了。
于是，通过地联的飞行器，一些位于地下世界基地城市的人类来到了这里，开始生活。
许多人类觉得，又能够来到地表世界了，太好了。
还有一些人类表达了对地表城市安全的担忧，觉得还是地下世界的城市基地更好，并没有返回地表城市生活。
过了一段时间，来到这里的人们很快地适应了这里的生活，许多人表示说，还是地表世界好，可以呼吸新鲜的空气，沐浴阳光。
人们又开始了生产生活。
地联的部队也开始在安全的位置对地表上的变异体进行持续的清理。
随后，帝国和地联的舰队又发生了数次的战斗。
