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朕的安排是巡抚节制提督，总兵高级将领，为防止巡抚权力过大，提督节制参将，游击，守备，都司等中下层军官，巡抚无权越级干涉。
巡抚、提督有权兵权，但无统兵权。参将，游击，守备，都司等中下层军官统领自己管辖内的军队，但没有调兵权，形成相互制约的管理体系。
陕西的情况特殊，三边总督和巡抚节制提督，总兵高级将领，提督节制参将，游击，守备，都司等中下层军官官。三边总督，巡抚、提督都有调兵权，但没有统兵权。参将，游击，守备，都司等中下层军官统领自己管辖内的军队，但没有调兵权。
另外，凡省提督，总兵，副总兵的选拔任用均由朕和枢密院决定，不足之处，诸卿补充。”
此事，杨肇基，孙承宗无过错，意见相左，无非立场各异。
此间，他还有许多话未说，镇戎之所以形成藩镇，除兵权外，最重要是就地征税，三边总督没有财权。
没有兵权，无疑是釜底抽薪。
朝廷设大户部，后勤部，转运使，其目的为保障兵勇军饷，粮草，装备，军服，届时，兵勇自然只认朝廷。
未来击溃建奴，灭掉套寇，收复西域，他将拆分三边总督。
三边总督在甘肃有肃王牵制，又难以干涉参将，游击，守备，都司统兵，京师还驻扎京营，五军。
若还让三边总督掀起浪花，他干脆直接禅位给崇祯。
百官窃窃私语讨论，杨肇基察觉皇帝安排更倾向武将，趁热打铁说：“陛下英明，诸事尚可，末将斗胆请求该尽早进行官吏任命，趁机划分出枢密院各大都督管理的疆域。”
此言出，兵部尚书朱童蒙出声附和：“陛下军制安排大方向没错，即使有错，朝廷在框架内修正。”
此言出，孙承宗，李国普，李邦华，吴牲等各自颔首，认可朱由校的安排，亦认可朱童蒙的说法。
没有完美的制度，朝廷军改制定好大框架，将来推行中查漏补缺。
顷刻，百官齐刷刷望向朱由校。
设枢密院，分陆军，水师二部，共八大都督，提拔任免均关乎朝廷文武格局，武将格局。
甚至，朝廷权力会进行重新洗牌。
龙椅上，朱由校早在思索人事安排，内心微微犯难。
目前，朝廷缺乏独当一面的将领，真正能用的袁可立，袁崇焕，王之臣，还全进士出身的文官。
近来杨肇基为首的武将表演亮眼，然而，也唯有杨肇基。
赵率教，满桂，朝廷另有他用，曹文诏，贺人龙，左良玉，祖大弼，周遇吉、孙守法、曹变蛟、左良玉、黄得功，金国凤，高杰等尚未崛起。
从陕西起义军刷经验的洪承畴，陈奇瑜，杨嗣昌，郑崇俭，孙传庭等文官，尚未有独当一面能力。
何人填充枢密院，主持大明军事，他有点犯难。
