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显微镜带来的震撼，如同投入平静湖面的巨石，激起的涟漪迅速扩散至整个朝堂，乃至金陵城的每一个角落。
“虫蛊之说”、“喝开水防时疫”以皇命政令的形式，以前所未有的力度推行开来。京营、衙门、乃至一些大户人家，都开始纷纷置办更大的炉灶，将饮用沸水作为头等大事。顺天府的衙役们更是走街串巷，宣讲卫生之道，虽然多数百姓仍觉得麻烦且将信将疑，但帝王的严旨和那被传得神乎其神的“能看到无数小虫”的仙器，还是让大部分人选择了服从。
然而，在这股由皇权强力推动的新风之下，暗流开始涌动。
首先发难的，并非后宫残余，而是自诩为儒家正统、秉持“子不语怪力乱神”的文官清流集团。
这一日，朝会之上。
朱元璋心情原本颇佳，正听着户部汇报推广沸水炉、采购药材的进展。突然，一名身着御史官袍、面容清癯、神色肃穆的中年官员手持玉笏，大步出班，噗通一声跪倒在金銮殿中央，声音高昂悲怆：
“陛下！臣，监察御史方孝孺，有本死谏！”
方孝孺！这个名字一出，满朝文武皆是一静。此人是当代大儒宋濂的弟子，以学问渊博、品行刚直、恪守古礼而闻名，在清流之中极具声望。
朱元璋的好心情瞬间消失，眉头皱起：“方御史，你有何本要奏？若是为防疫新政，便不必多言了，此事咱意已决！”
方孝孺却猛地以头叩地，砰砰作响，声泪俱下：“陛下！正为此事！臣闻近日宫中出一异人，以奇技淫巧之物，妄言什么‘虫蛊致病’，蛊惑圣听，更挟此以令天下，劳民伤财，大兴炉灶，致使民间怨声载道，士林哗然！此等荒谬之言，违背圣贤之道，背离阴阳五行之理，实乃祸国之兆！臣恳请陛下，立刻废止荒谬新政，逐黜妖言惑众之奸佞，以正视听，以安天下民心！”
他这番话，引经据典，将自己摆在了维护圣贤正道、为民请命的高位上，直接将林奇打成了“异人”、“奸佞”，将显微镜和防疫政策定性为“奇技淫巧”、“荒谬之言”。
有了他带头，立刻又有七八名言官和翰林院清流官员出班跪倒，齐声附和：
“陛下！方御史所言极是！子曰：‘敬鬼神而远之’，岂可尊奉虫蛊邪说？”
“《黄帝内经》有云：‘正气存内，邪不可干’，疾病乃阴阳失调所致，与虫蛊何干？此乃歪理邪说！”
“煮沸饮水，或可去其寒性，然言可防时疫，无稽之谈！徒耗柴薪，增加民负耳！”
“请陛下诛佞臣，废邪说！”
一时间，金銮殿上唾沫横飞，仿佛林奇和新政成了十恶不赦、动摇国本的祸根。他们不敢直接指责朱元璋，便将所有矛头都对准了尚未有正式朝会资格的林奇。
端坐龙椅之上的朱元璋，脸色已经阴沉得能滴出水来。他早就料到会有人反对，却没想到是以这种“死谏”的方式，而且带头的是方孝孺这等清流领袖。这让他感到极度不耐烦，却又不能像对待普通官员那样直接打杀了事，这些人最重的就是名声，杀了他们反而成全他们的“清名”，还会寒了天下士子之心。
“都给咱闭嘴！”朱元璋猛地一拍龙椅扶手，发出巨响，震得殿内嗡嗡作响，“虫蛊之事，乃咱亲眼所见！显微镜下，万千虫蛊蠕动，岂能有假？！防疫新政，是为了救民于时疫水火，岂容你等在此聒噪！”
方孝孺却梗着脖子，毫不退缩：“陛下！纵有奇器可见微物，然此物是真是假，是幻是实，皆由那异人一言而定！谁知是否为幻术欺君？即便真有微虫，又如何证明其便能致人疾病？圣贤经典从未记载！此乃以未知之奇技，动摇已知之圣道！臣恐此例一开，后世奸佞纷纷效仿，以奇技淫巧取悦君王，则国将不国矣！臣今日宁可血溅金銮，也绝不容许圣道蒙尘！”
这话就极其诛心了，直接将争论拔高到了“圣道”与“奇技”、“正道”与“奸佞”的意识形态斗争层面。
朱元璋气得额头青筋暴跳，恨不得立刻让锦衣卫把这群酸儒拖下去砍了。但他知道，对付这些人，光靠杀人不行。
就在朝堂之上僵持不下、火药味浓烈至极之时，一名太监匆匆走到御前，低声禀报了几句。
朱元璋闻言，阴沉的脸上忽然露出一丝奇异的神色，他冷哼一声，对着下方跪倒一片的官员们说道：“好！你们不是要证据吗？不是不信虫蛊能致病吗？咱今天就让你们心服口服！退朝！所有五品以上官员，都给咱移到东宫校场！”
说罢，他拂袖而起，率先离去。
满朝文武面面相觑，不知皇帝陛下葫芦里卖的什么药。方孝孺等人互相对视一眼，皆从对方眼中看到了决绝，今日定要抗争到底！
众人移步东宫校场。只见校场中央已临时搭起一个棚子，棚内摆放着那架珍贵的显微镜和一些琉璃片、水碗等物。林奇一身青色官袍，早已静立在一旁，神色平静，仿佛早已料到今日之事。
而更让人惊讶的是，太子朱标竟然也在宫人的搀扶下坐在了一旁！他的脸色依旧有些苍白，但精神看起来不错，目光温和却带着一丝不容置疑的威严。
朱元璋大马金刀地坐在主位，指着显微镜，对着以方孝孺为首的文官集团冷冷道：“东西就在这里！你们谁不信，自己上前看！看看那生水污水里，到底有没有虫！”
方孝孺等人骑虎难下，互推了一番，最终由方孝孺率先上前。他带着悲壮的神情，如同赴死就义般，将眼睛凑近镜筒。
